皇姑寺明代初稱黃村寺，天順年間改稱順天保明寺，在明代是太后娘娘的香火院，在清代是康熙皇帝的行宮，這座寺廟最大的特點是跟明清皇家有很大的關系。
皇姑寺明末清初，皇姑寺毀于大火，康熙皇帝頒旨由朝廷出資重建�？滴跷迨辏�1711），保明寺舊基重建，康熙五十八年（1719） 落成， 易名“敕建顯應寺”。
皇姑寺在明代初稱黃村寺，天順年間改稱順天保明寺，民間根據呂尼救英宗的傳說，俗稱皇姑寺�；使盟逻z存兩口明代銅鐘，均收藏于大鐘寺博物館。一口是黃村寺鐘，原鑄于“大明天順六年(1462)”,原置“黃村寺大悲觀世音殿”,“大明嘉靖十二年（1533）三月二十一日奉懿旨重造”, 重要捐資人是“昭圣康惠慈壽皇太后”、“章圣慈仁皇太后”、昌國公張鶴齡、建昌侯張延齡以及司禮監、內官監、御馬監眾太監等�！罢咽タ祷荽葔刍侍蟆睘槊餍⒆诨屎�、武宗的生母、世宗的伯母，武宗時尊為“慈壽皇太后”，世宗入繼稱圣母, 嘉靖三年（1524）上“昭圣康惠慈壽”尊號。昌國公張鶴齡、建昌侯張延齡是昭圣康惠慈壽皇太后的兩個同胞兄弟�！� 章圣慈仁皇太后”是世宗親生母親，尊為圣母。這口鐘翻鑄時間正好處于嘉靖皇帝佞道毀佛之際，《萬歷野獲編》中非常詳細地記載了毀皇姑寺始末，嘉靖皇帝認為皇姑寺名稱不好，主張毀掉，兩位皇太后出面極力攔阻，礙于皇伯母的情面和母后的威儀，嘉靖只好隱忍作罷，皇姑寺得以幸存。兩位皇太后下懿旨翻鑄黃村寺銅鐘，明確向世人宣告皇姑寺是太后娘娘的香火院，誰也別想毀掉它，皇帝也不例外。另一口為保明寺鐘，鑄于明隆慶六年(1572)，領銜者為“慈圣皇太后李氏”�！按仁セ侍罄钍稀笔敲魃褡谏�, 十分崇信佛教, 多次出資修建寺廟，如慈壽寺、慈恩寺、萬壽寺、拈花寺、長椿寺等廟宇皆與其有關�！睹魇贰飞险f她“顧好佛, 京師內外多置梵剎, 動費巨萬, 帝亦助施無算”, 尊為“九蓮菩薩”，號召力極大，她一倡議鑄鐘，王公大臣紛紛解囊，鐘銘文中的重要歷史人物還有太師成國公朱希忠、太師定國公徐光祚、錦衣衛左都督朱希孝及司禮監掌印太監馮保等，捐資者多達1300 余人。
皇姑寺曾一度作為康熙皇帝的行宮，在《日下舊聞考》卷86 乾隆《御制靜宜園記》中有所披露：“昔我皇祖于西山名勝古剎，無不曠覽。游觀興至，則吟賞托懷，草木為
之含輝，巖谷為之增色�？制鸵凼虖闹蓟蛴兴鶆谝�，率建行宮數宇于佛殿側，無丹之飾，質明而往，信宿而歸，牧圉不煩，如岫云、皇姑、香山者皆是……于是乎就皇祖之行宮，式葺式營，肯堂肯構，樸簡是崇，志則先也，動靜有養，體智仁也�！笨梢娽对疲ń裉惰纤拢�、皇姑、香山諸寺都是康熙皇帝的行宮�？滴趸实蹮嶂晕⒎皆L，又酷愛西山風景，皇姑寺毗鄰京西古道，從他重建皇姑寺、御制碑文、改名賜額及各殿對聯等跡象看，他極有可能經常來西山游玩，并在皇姑寺、八大處等行宮中夜宿過。斗轉星移，歲月滄桑，皇姑寺門額、殿額、殿聯等實物不復存在，有的幸存拓片，現寺院內兩通龜趺螭首的康熙御制碑保存完好，且滿漢文對照，矗立在老祖殿前面，向人們訴說著那一段鮮為人知的歷史。
康熙皇帝御制《顯應寺碑記》，以紀其事，寺額、殿聯等多為康熙御筆�！度障屡f聞考》卷97 載：“觀音殿內懸圣祖御書額曰‘ 水心柏子’， 聯曰：‘ 片石孤云窺色相，清池皓月照禪心’；老祖殿額曰：‘林泉花雨’，聯曰：‘月在上方諸品靜，心持半偈萬緣空’；寺后閣額曰：‘掛衲翻經’，寺門額曰：‘敕建顯應寺’，又天王殿亦有‘顯應寺’三字額，皆圣祖御書�！边@些記載足以說明康熙皇帝對皇姑寺非常重視。
